Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FlgP11088 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FlgP11088 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FlgP11088 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FlgP11088 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FlgP11088 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FlgP11088 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FlgP11088 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FlgP11088 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms