Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3cP0DOY1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms