Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csf3P09920 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csf3P09920 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms