Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tk1P04184 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tk1P04184 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tk1P04184 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tk1P04184 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms