Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lamc1P02468 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamc1P02468 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms