Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01822 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01822 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01822 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01822 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01822 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01822 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01822 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01822 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01822 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01822 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms