Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01643 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01643 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01643 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01643 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01643 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01643 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01643 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01643 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms