Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01638 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01638 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01638 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01638 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01638 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01638 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01638 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01638 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01638 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01638 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01638 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01638 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01638 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01638 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms