Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setdb1O88974 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setdb1O88974 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms