Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms