Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfdp1O88271 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfdp1O88271 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms