Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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