Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

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Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtogO55225 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtogO55225 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtogO55225 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtogO55225 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtogO55225 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtogO55225 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtogO55225 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtogO55225 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtogO55225 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtogO55225 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtogO55225 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtogO55225 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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