Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarce1O54941 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarce1O54941 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms