Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb3O54890 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb3O54890 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb3O54890 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms