Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp10aO54827 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atp10aO54827 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp10aO54827 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms