Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klrk1O54709 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klrk1O54709 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klrk1O54709 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klrk1O54709 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klrk1O54709 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klrk1O54709 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Klrk1O54709 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms