Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc1O35379 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc1O35379 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms