Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms