Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NumblO08919 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NumblO08919 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NumblO08919 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NumblO08919 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NumblO08919 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NumblO08919 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms