Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eftud2O08810 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms