Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CckarO08786 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CckarO08786 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CckarO08786 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CckarO08786 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CckarO08786 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms