Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm8050L7N2E3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8050L7N2E3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms