Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms