Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms