Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmgxb3G3X9M3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms