Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34aG3UW52 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn34aG3UW52 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms