Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D430041D05RikF6ZGR6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms