Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Raph1F2Z3U3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms