Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Rnf165E9QAU8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms