Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf4E9QAP7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4E9QAP7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms