Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ythdc1E9Q5K9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms