Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BC005561E9Q5E2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BC005561E9Q5E2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms