Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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