Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ryr1E9PZQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms