Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chd2E9PZM4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd2E9PZM4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms