Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp54bE9PXC0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms