Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Soga1E1U8D0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga1E1U8D0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms