Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl3E0CZ16 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms