Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
3425401B19RikD3Z1D3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms