Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf217D3YYI7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf217D3YYI7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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