Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptprz1B9EKR1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms