Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cttnbp2B9EJA2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cttnbp2B9EJA2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Cttnbp2B9EJA2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cttnbp2B9EJA2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms