Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cspp1B2RX88 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cspp1B2RX88 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms