Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cped1B2RX70 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cped1B2RX70 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms