Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Abcc8B2RUS7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Abcc8B2RUS7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms