Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf3B2KF05 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms