Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn7aB1AYL1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms