Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700084M14RikB1AT01 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms