Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Odf2A3KGV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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